元世祖十分看不起忍辱偷生的全太后，所以就砍下了那四个宫女的头颅，悬在全太后的门口，以示羞辱。全太后顾念年幼的恭帝，不忍自杀。
不过，由于这时南宋遗臣已经立赵量为端宗，老奸巨猾的元世祖就将恭帝封为开府仪同三司、检点大司行政、瀛国公，做样子给天下人看。元世祖希望利用恭帝潜在的号召力，对端宗形成制约,顺便招降那些尚未归附的宋将。
后来全太后提出水土不服，向元世祖请求迁往南方。元世祖的皇后对全太后的遭遇特别同情，就帮全太后求情，但是元世祖担心节外生枝，没有同意。不过他当时并没有打算杀害全太后和宋恭帝。传说元世祖已经准备让恭帝与全太后在大都的深院中慢慢了却此生。
可是到了至元十九年（1282）年底，元世祖却突然命恭帝迁出大都，并将他安置在上都，还让全太后到大度正智寺削发为尼。不久后，全太后就悄无声息地死在了那里。
原来福建有位僧人向元世祖解说了当时的天相，说他夜观星相，发现土星有侵犯帝祚之势。所以按常例来推算，恐怕不几日将会有人要加害元世祖,希望元世祖多加提防。元世祖本来不相信这位僧人所说的话，可是在这位僧人离开后没多久，就有离大都不远的中山县(今河北省定县)官员禀报说:县内有一个狂人，自称是宋王，扬言要聚集人马，前往京师劫掠宋丞相文天祥，起兵复宋。
