黄巢的政治诉求和理想，在他征战福建时就有体现。
《新唐书》记载：【初，军中谣曰：「逢儒则肉，师必覆。」巢入闽，俘民绐称儒者，皆释，时六年三月也。儳路围福州，观察使韦岫战不胜，弃城遁，贼入之，焚室庐，杀人如蓺。过崇文馆校书郎黄璞家，令曰：「此儒者，灭炬弗焚。」】
按【整众不剽掠，所过惟取丁壮益兵】一说，黄巢对于捕获的儒生，并不强抓为兵，而是加以释放。攻破福州城时虽发生了一定杀掠暴行，但黄巢约束士众不去侵扰儒士，足见黄巢并非粗才，心有治国之丘壑。
黄巢军一方面诛杀贪官污吏，一方面又维持官僚制度的秩序，这点是有史为证的。进入长安时，义军慰晓市人说："黄王为生灵，不似李家不恤汝辈，但各安家""遇穷民于路，争行施遗"或"竞投物遗人"。在进入长安后，义军规定："唐官三品以上者悉停任，四品以下位如故"。一开始也未有任何滥杀，所杀的都是罪大恶极的贪官恶将，如宰相崔沆、仆射于琮、金吾大将军张直方等人。
另外，唐代诗人韦庄在名作《秦妇吟》中也只说"内库烧为锦绣灰，天街踏尽公卿骨"，可见黄巢起义军绝非乱杀一般人民。
