南京城陷，朱棣和朱允炆这对叔侄到了该见面的时候了，但并没有，因为朱允炆失踪了，《明史》记载："宫中火起，帝不知所终。燕王遣中使出帝后尸于火中，越八日壬申葬之。"
虽然朱棣下令从火中找出了朱允炆和其皇后的尸体并安葬，但无论是朱允炆还是当时的人甚至后世之人，都不认为朱允炆真的在这场大火中被烧死了，所以历来，对于朱允炆的行踪，通常都是用四个字来表述，即"不知所终"。
也因此，朱棣一直没有放弃寻找朱允炆的下落，甚至传言郑和下西洋有一个重要的任务就是寻找朱允炆，但无论朱棣怎么找，依旧没有朱允炆的下落，这个皇帝就像是人间蒸发了一样，一场大火之后寻不到他的丝毫印记。
当然，虽然朱允炆消失了，但关于他的话题和传说一直存在，关于靖难之役后朱允炆的下落，大体有那么几个说法比较流行。
