可惜此时的朝鲜，"民生涂炭，国力虚弱"，实在拿不出力量主动出击进攻后金。只得在边境"修城筑池，以为死守之计"，若"贼来犯，必以干戈击之。"同时，对东江镇明军运送大量粮草、给养、装备，对其军事行动提供各种支持便利。毛文龙在朝鲜的支援下发展壮大，对后金后方产生了严重的威胁，让后金如鲠在喉。因朝鲜援助毛文龙，努尔哈赤怒火中烧，把朝鲜信使都杀了。
二、 为明朝两次被打，口服心不服
朝鲜力挺明朝的方针，引起后金的极大不满，皇太极打算把毛文龙和朝鲜一道摆平。"朝鲜屡世获罪我国，理应严讨。""毛文龙近彼海岛，倚恃妄为"。在1627年，2月28日，大贝勒阿敏率大军东征朝鲜。朝鲜军队哪里是凶强彪悍的八旗铁骑的对手，一路溃败，连丢义州、定州、安州、平壤、中和、平山数城。兵锋直逼王京汉阳。仁祖见朝军毫无招架之力，只得逃入江华岛，同后金议和。
后金要求朝鲜送王子作人质，停止给大明称臣，文书停用明朝年号。但是得到朝鲜仁祖的拒绝，"我国于南朝，父子之国，岂可以危急存亡，变易臣节？"。因为后金此次孤军深入朝鲜，正面战场还面临着明军的威胁，虽然军事上占有上风，也不敢在朝鲜逗留太久。
