其中西路军进攻顺利，一路势如破竹进攻河西走廊，获得全胜，占领甘肃。而东路军李文忠部向东进攻损失很大，并无重大战果，最后无功而返。
此战虽然北元在西北损失不小，但是朱元璋消灭北元，占领哈拉和林的战略目的并没有获得成功，中路明军徐达所部几乎是全军覆没。
洪武十三年二月，北元国公脱火赤、枢密知院爱足率领上万人在和林屯扎，怀疑有南侵动向。十一日，朱元璋命令西平侯沐英率其陕西明军进攻北元，明史记载明军攻入哈拉和林，活捉了脱火赤、爱足。
洪武十四年正月，北元平章乃儿不花等南侵明边境。四月十五日，朱元璋任命魏国公徐达为征虏大将军，信国公汤和为左副将军，颍川侯傅友德为右副将军，分两路出塞北征。最后得胜而还。
元廷退出中原后，元朝梁王把匝剌瓦尔密坚守云南，并派遣使者去漠北觐见北元皇帝，继续忠于元朝。其间曾对抗明玉珍明夏政权的进攻。朱元璋平定四川后，因云南地险，不愿用兵，试图劝降，但是梁王不为所动。洪武十四年（1381年）秋，沐英担任征南右副将军，与永昌侯蓝玉一起跟随傅友德攻取云南 。
1382年1月6日，元梁王把匝剌瓦尔密兵败，把匝剌瓦尔密知道无法获胜，于是焚烧龙衣、驱妻子到滇池死。自己则与左丞达德、右丞绿尔夜入草舍自尽，数月后，元朝云南大理总管段氏投降明军，明军征服云南地区，元朝对云南的统治结束。明军占领云南。
1371年，元朝辽阳行省平章刘益降明，明朝控制今辽宁南部。然而之外的辽阳行省地区仍由元朝太尉纳哈出控制，纳哈出屯兵二十万于金山，自恃畜牧丰盛，与明军对峙了十几年，多次拒绝明太祖的招抚。1387年，冯胜、傅友德、蓝玉等人发动第五次北伐，目标是攻占纳哈出的金山。经过多次战争，1387年10月，纳哈出投降蓝玉，明军俘获纳哈出的军民24万余人，牲畜辎重无数。六月底，傅友德以新得到的辽地汉人军士驻守大宁，冯胜等胜利班师。辽东从此成为明朝势力范围，后来成为奴儿干都司的一部分。
