到了嘉靖皇帝在位中期，朝廷关闭海上贸易，由此，而引发了一系列的大规模的影响。
那时，明朝的沿海地区出现了倭寇，虽然数量不多，但是，他们的战斗力却极强，明军根本招架不住。70多个倭寇就能一路杀到南京城下，逼得南京告急，而官府只能直接召集百姓上城抗敌。
之所以出现这种情况，是因为当时南京直属的兵力在册编制是12万，其中，4万在城边，但是，实际上，南京城内只有1700多人，其亏空数量可见一斑。而这种情况不仅出现在南京，整个江南地区基本都是这个样子。
所以，明军虽然在表现上兵力数量较大，优势明显，但是，实际上跟倭寇的人数差不多。而且，战斗力还不如人家，因此，明军屡战屡败也就不足为奇了。虽然，后期出现了俞大猷和戚继光两位大神，使得明军的战事局面，发生了一定程度上的扭转，但是，却没有从根本上解决实际问题。
