即使已经选用依山为陵的帝陵模式，朱元璋仍然觉得不够安全。朱元璋将明孝陵内部的墓道专门设计成弯弯曲曲的路，即使盗墓贼侥幸发现隐藏的墓道口，也要让其在迷宫般的墓道中迷失方向，有来无回。
如果觉得这样的安全级别就满意了，那就不是明太祖朱元璋了，在明孝陵的设计中还有最后的兜底防盗措施--流沙防盗法。在明孝陵上方的封土层平铺一层的鹅卵石，如果盗墓贼阴差阳错地来到朱元璋和马皇后居住的地宫核心区域，上方的鹅卵石就会从宝顶倾斜而下，将盗墓贼永远地掩埋在地宫之中。
二是明太祖的历史地位。
明朝历史上共有16位皇帝，只有明朝开国皇帝朱元璋葬在南京的明孝陵，其余13位皇帝则葬在北京昌平区的天寿山明十三陵。
