后来蒙古人崛起，蒙古人是拥有贝加尔湖的。当蒙古人南下灭掉南宋，建立元朝的时候，贝加尔湖也在蒙古人手里。不过，蒙古人并不怎么重视这里。
清朝采用联姻的方式，吞并了蒙古。从这个意义上说，贝加尔湖似乎也进入了清朝的地盘。但是，似乎又算不上。因为那时候蒙古已经变得很弱，而俄罗斯已经大肆向东扩张，他们已经早已占领了贝加尔湖。清朝与俄罗斯在签订《尼布楚条约》之前，俄罗斯已经占领那里了。他们不但占领了那里，还想向黑龙江渗透。清朝为了防止他们的这种渗透，因此，才和俄罗斯划定了界限。
从以上的分析，我们可以看出，历史上，贝加尔湖确实曾属于"中国"，不过在清朝与俄罗斯签订条约前，俄罗斯已经占去了。
（参考资料：《中国通史》等）
