朱由崧政权倒台后，朱以海在大臣钱肃乐、张煌言、郑遵谦、张国维等人的拥立下于1645年7月18日在绍兴监国，由于朱以海从山东逃亡而来，在浙江绍兴并无嫡系军队，只能依靠方国安和王之仁两位将军，然而此二人有挟天子以令诸侯的野心，对其他所部大加排挤，将朝廷下拨的六十万钱粮擅自霸占分配，其他各部由于无粮无饷，不久之后便四分五裂，自行瓦解，抗清力量大大削弱。
公元1646年，朱聿键派大将携带白银十万两前往浙东犒劳朱以海的军队，想要笼络军心，然而却被朱以海杀害，鲁王、唐王政权天天算计、互挖墙脚，朱以海为分解唐王内部，竟派人来福州封郑芝龙兄弟为公爵，朱聿键得知后勃然大怒，不仅杀了使者而且大加训斥郑芝龙，郑芝龙对朱聿键日渐不满。正当鲁王唐王二人为争夺帝位互相斗争时，清军趁机而入。
