三、逆历史潮流
因为上帝教教义不伦不类，导致洋人、读书人、以及一部分老百姓都站在了它的对立面。如果从更深一层的层面来看太平天国的失败，可以归结为其政教合一的国家体制，完全是在逆历史潮流而动。孙中山先生曾说，世界潮流，涪浩荡荡，顺之者昌，逆之者亡。
欧洲历史上曾出现过政教合一的制度，或由教会控制政权，或由君主兼任教主。近代以来，欧洲各国通过艰苦卓绝的努力，与基督教宗教专制进行了艰苦决绝的，前赴后继的斗争，付出了无数生命，鲜血和牺牲，才完成了政教分离。虽然仍有少数国家实行这一制度，但教会的势力已经远不如前。
政教分离要求"上帝的归上帝，恺撒的归恺撒"，即宗教不干预国家政治，国家政治也承认宗教的独立和自由。1779年，"宗教自由法案"还正式写入美国宪法第一修正案，在人类历史上第一次从法律上斩断了两只手，一只是教会伸向政权的手，任何教会休想用策立国教的形式攫取世俗权力；另一只手是世俗政权伸向宗教的手，统治者休想利用教会干涉人民信仰自由，用神权增加其政权的合法性和稳固性。
政教之所以要分离，一是现代社会发展的需要。欧洲文艺复兴运动倡导以''人性''来替代''神性''，以''人道''来替代''神道''，是现代社会发展的肇始。二是塑造现代人的需要。塑造现代人的一个基本着眼点就在于教育的世俗化，另外还包括思想观念和制度层面的世俗化。同时，社会的稳定有赖于共识的形成和对国家的高度认同，但是宗教与政权的结合容易导致不同宗教或教派的冲突，对社会稳定形成重大影响，也就难以保持社会的和谐。
