明朝时局稳定，天下富庶，所以具备重抄的条件。在徐阶的努力之下，重抄的官员工作条件极为优越，不仅每天有没事美酒，更有浆果辅食。特别值得一提的是，重抄官员可以不上早朝，同时能拿到重抄津贴。官员的积极性极度激发，但可惜的是朱棣时期的书法家造诣较高，嘉靖年间的抄本字体上稍有逊色。隆庆初年完成抄录时，世间流传的《永乐大典》应该正副本两套。
众所周知，如今世间流传的《永乐大典》仅剩嘉靖年间抄本，且全文剩余不到全书的百分之四。清代后期，八国联军进入北京，此次侵略带来的不仅仅是圆明园的毁灭，还有保存在翰林院的《永乐大典》。外国侵略者对于珍宝仅抱有两种态度，一是带走，二是毁灭。而《永乐大典》则是后者。在这之后，珍本仅有极少部分被转卖各国。如今传世的仅剩400册左右，且无一例外俱是嘉靖副本。
此时，对于帝国主义侵略者的憎恨必然存在，但是全部归咎于帝国主义侵略者也是对历史的不尊重。实际上在康熙年间，我国记录的副本就已经少了一千多册，而正本也早早杳无音讯。乾隆爷编纂《四库全书》概念初起时，所记载的《永乐大典》只存9881册，而光绪二十六年所记载副本存量更是不足800册。所以，八国联军对于《永乐大典》的损毁仅在400册前后，而更多的是被朝廷官员内部腐蚀殆尽。
