顺治十五年，王弘祚在《滇南十义疏》中，提出"除汉人士庶衣帽、剃发遵照本朝制度外，其土司各从其俗，俟地方大定，然后晓以大义，徐令恪遵新制，庶土司畏威怀德，自凛然恭奉同伦同轨之式矣。"
清朝的"改土归流"革新
清朝土司制度的重要特点就是"卫司合一"，不论从明朝的《土官底簿》还是《明史.土司传》，西北地区都没有被列入土司，说明明朝并不认为西北地区属于土司地区，西南土司与西北羁縻卫所是有区别的，因而明朝在卫所与土司上有分立的，但进入清朝后，西北地区也有了土司的称呼。明朝羁縻卫所的官职是靠战功晋级，而到了清朝，卫所战功升职制度改为土司世袭制度，卫司合一使得清朝的土司急剧增加。
清雍正时期，开始了大规模的"改土归流"，但在"改土归流"的实施中，因地域的多变与复杂性，并没有进行到底。
1.顺治、康熙朝的小规模改土归流
