1408年的时候，黄元寿让自己的妹妹黄元丽镇守渤泥，黄元寿自己率领150多人开启了航程。后来黄元寿到达了明朝，不过这时候的朱元璋已经不在了，接见黄元寿的是明成祖朱棣。看到家乡的变化之后，黄元寿是感慨万千。
朱棣特意下旨令使团进京沿途的每个府县都要设宴招待，可是此时的黄元寿已经经历不了长途跋涉，同年十月，黄元寿病逝，享年六十七岁。黄元寿病逝前，向明成祖朱棣提出了一个非常重要的要求，就是黄元寿想要落叶归根，他想要自己安葬在明朝。
黄元寿病逝后，朱棣允许让其安葬在南京安德门外，并以王礼赐葬。后来渤泥国被册封为明朝的藩属国。
16世纪末，因王室内讧不断，渤泥的国势再次转衰，而此时西方殖民者的乘机入侵，又给国家带来生存上的压力。从19世纪早期开始，渤泥相继将沙巴割让给英国北婆罗洲公司，把砂劳越赠与英国人詹姆斯·布鲁克，由此丢失绝大部分国土。最终，"缩水版"渤泥国在1888年沦为英国的"保护国"，并改国名为文莱。
