相对来说，如果设总督，重点放在军事上。比如嘉靖时的名将胡宗宪，他当上浙（江）直（南直隶）总督，主要对付倭寇，民政管的不多。
巡抚，本来作动词用，一边"巡"一边"抚"，后来成了名词。明朝的巡抚，在一省范围内，有时职权比总督还大。因为巡抚要统管民、军、法三司。巡抚有两种，一种是非边塞地区的巡抚，吏部和户部推荐巡抚人选，比如河南、湖广等不沿边的省份。如果是边塞地区的巡抚，要由吏部找兵部推荐人选，比如山西巡抚。这种内、边分离的巡抚推荐制度，直到嘉靖十四年，1535年才废除。九卿大臣开会，吏部官员主持，推荐总督或巡抚的合适人选，然后由皇帝批准。如果是推荐布政使，则三品以上官员都可以推荐。
