对于这一情况，可能存在两种可能：
第一种可能是清廷意欲斩草除根，以绝后患，所以曾下令将永历帝杀死，但为青史留名，史书多将这一命令隐讳不录；第二种可能便是当时全国大局已定，清廷为笼络人心，打算放过永历皇帝一条性命。不过无论是哪种情况，真正的执行者确实吴三桂。
就当时的情况来看，吴三桂在处置永历皇帝的态度上颇为坚决，那就是绝不姑息。不管清廷是何种态度，最终的结果是吴三桂否决了爱星阿将永历皇帝献俘北京的建议，而是奏请朝廷直接在云南当地处死永历皇帝。吴三桂主张处死永历帝原因如下：
第一，害怕献俘北京途中永历帝脱逃。吴三桂擒获永历帝可以说是费了九牛二虎之力，而当时清朝的局势尚不稳定，反清势力尚未完全平息。云南距京城遥远，献俘北京不能确保万无一失。
