经过宰相们的商议，最终决定给王仙芝封了一个左神策军押牙兼监察御史的官职，王仙芝一听还不错，比起义强，于是准备投降。就在这个时候，黄巢不干了，大家一起干，到头来只有王仙芝一个人有官做，其他的人可能面临的结果并不怎么妙，黄巢打了王仙芝一顿，这让其他的首领们很痛快，王仙芝也不敢投降了。之后王仙芝和黄巢暂时分开。
王仙芝领三千人劫掠了蕲州之后进攻鄂州，而黄巢引两千人北上，在今山东一带攻破郓州、沂州，随后两人有过短暂的合兵，攻打宋州，只是被张自勉打败，随后再次分兵，黄巢继续回到山东一带，而王仙芝进攻安州、随州、复州、郢州。
878年的二月，王仙芝战死，部下死伤五万人，尚君长的弟弟尚让带着部分余众投靠了黄巢，自此，黄巢成为真正的起义军首领。
