在多次医疗鉴定中，医方都坚称手术时间是17：30—19：30，因而不可能在短短2小时内同时完成车祸治疗和肾切除手术。但周家坚持手术时长近8小时，并指出医院将入院时间从“压伤后3小时入院”改成了“压伤后6小时入院”。因为周家拿到的有周父签名的《外科术前小结》中载明是前者，但医方在法庭上提供的没有周父签名的《出院小结》中变成了后者。
2008年9月5日，终审判决中，鹰潭中院指出，经多方鉴定机构鉴定，均未得出周福斌左肾是“萎缩”还是“缺如”以及对应原因。但因考虑到周福斌年纪尚小，损伤较重，将补偿金额从12万元增加至15万元。
第二年，周家又向江西省高院提起了再审申请，最终被驳回。至此，有关周福斌“丢肾”一案落下帷幕，但留下了一个至今仍未解决的疑问——左肾到底是缺如还是萎缩？
在那5年里，为了解答这个问题，周福斌做了11次相关检查。而这些检查呈现出一个“规律”——凡是周家单独去做检查时，结果都是“左肾缺如”，而由官方陪同和委托去做检查的时候结果都是“萎缩”。
这其中有两次“例外”，但之后都通过会诊的方式得以纠正。2004年8月31日，由贵溪医院陪同所做的MRI检查显示左肾未显影，但这个结论在应一审法院要求会诊后，变更为：左肾细小。2007年6月19日由法官、政法委副书记等陪同，在重庆大坪医院所作的结果为“左肾缺如”的CT检查，在5天后的会诊中变更为：左肾萎缩。
2007年6月15日重庆大坪医院CT显示:右肾正常，左肾缺如
其余各次检查，均符合上述“规律”。
