为了免遭杀身之祸，石达开在1857年5月被迫离京出走，并带走十几万精锐之师。此后数年间，石达开转战东南、西南各个省份。1863年5月，石达开到达四川大渡河，由于天降大雨河水暴涨，无法渡河。最后被清军追上，苦战陷入绝境。
石达开为了"舍命以全三军"，他先遣散4000将士，留下的2000人携带武器，石达开决定跟清军谈判，但清军背信弃义，太平军两千将士全部战死。
1863年6月25日石达开被押往四川成都，在接受公堂审问时，他慷慨陈词，令主审官无言以对。6月26日，石达开和下属被凌迟处死，行刑时他的下属惨叫不已。唯独石达开意志坚定，被割一百多刀，始终不吭一声。
