朱元璋想到了把他与十二年前被处死的胡惟庸联系在一起。
洪武十三年正月，朱元璋借御史中丞涂节、商皓告发左丞相胡惟庸谋反，决定正式向胡惟庸发难。
朱元璋下令廷臣轮番讯问，迅速诛杀胡惟庸及其亲信陈宁、涂节。朱元璋并未因此罢手，继续调查胡惟庸问题。洪武十九年十月，朱元璋给胡惟庸定了一条通倭的罪名。
李善长的家奴卢仲谦自首告发李善长和胡惟庸往来情况，而陆仲亨的家奴封贴木也自首告发陆仲亨与唐胜宗、费聚、赵庸三侯与胡惟庸共谋不轨。朱元璋大发雷霆之怒，肃清逆党，词语相连，被诛杀者达三万余人，于是做《昭示奸党录》，布告天下。此案株连蔓引，直到数年之后，还没有清除干净。
胡惟庸之死，似乎证据确凿，毕竟他不得人心。
