而这还不是最糟糕的情况，还有更糟糕的等待着史可法。
马士英为了防御左良玉南下，决定专以对付上游的左良玉为最紧急的大事，而置清兵的进攻于不顾。在清军南下的情况下，马士英调令黄得功率兵镇守芜湖，刘良佐和刘泽清也进行调整，防卫对象全部变成左良玉，而不是清军。弘光皇帝听信马士英的言语，下诏让史可法督诸军渡江入援朝廷。
此时的史可法见清军步步进逼，三次向朝廷告急。史可法上奏朝廷："上游不过欲除君侧之奸，原不敢与君父为难。若北兵一至，则宗社可虞。不知辅臣何以蒙蔽至此!"
但是马士英对他的要求置之不理。大理寺卿姚思孝请求加强淮扬守备，弘光皇帝本来已经表示同意，而马士英居然指责他们是左良玉的同党，坚决不执行，最后竟然说出"我君臣宁死于清，不可死良玉手"这样的话出来。
史可法知道守卫扬州的重任只有自己一人了。
