1644年是一个不平凡的一年。
这一年，李自成夺取了北京城，崇祯皇帝自杀，明朝正式宣告灭亡。但是仅仅41天，李自成即狼狈西逃，北京城再次易主，清军在带路党吴三桂的帮助下击败李自成，占据了北京城，清朝正式入关，走向统一天下之路。
南京是明朝在南方地区的政治经济文化军事中心，在明朝，北京南京并列为两京，南京地势险要，有长江天堑，又是明朝朱元璋朱允炆时期的京城，即使明成祖朱棣迁都北京城，这里依然有除了内阁之外的一整套官僚机构班子，比如六部，科道，宗人府，五军都督府，国子监等等。
南京除了地理优势之外，还有充足的防卫设施、驻军也不少，是一个理想的军事要塞，加上不管是清军，还是农民军都是北方人，明朝的水师更加具有优势。
