后来隋军大规模入侵，陈后主对他说："你可为我决此一战。"萧摩诃说："从来打仗，都是保卫国家，今日之事，不光卫国也是守护妻子儿女。"但是此时大势已去，隋军汹涌而来，萧摩诃为贺若弼所擒。 到京城陷落，贺若弼将后主安置在德教殿，命令卫兵看守，萧摩诃请求贺若弼说："今已为囚俘，命在顷刻，愿得旧主一见，死无遗恨。"贺若弼很同情他就同意了。萧摩诃入见后主，俯身伏地而哭。并在厨房取来食物进奉给后主，辞谢诀别而出，守卫的士兵都不敢仰视他。
隋灭陈后，萧成为隋的臣下，不久他跟随汉王谅一起谋反，那一年他已经73岁了，很快被处死，一代英雄就这样陨落。
