那么朱由检是怎么最终还是葬入明十三陵了呢？当年李自成攻入北京后，到处搜寻崇祯的踪迹，但是一直没有找到，以为崇祯逃出了京城，但没想到却得到了崇祯自缢于煤山的消息。也正是因为朱由检的无人问津，于是李自成得以见到了朱由检的尸身，也见到了这位皇帝留下来的血书：任贼分裂朕尸，勿伤百姓一人。
而李自成被崇祯皇帝的遗言打动，或者是有心计的部下劝说李自成，可以利用崇祯尸体来做文章，厚葬崇祯，向天下显示他的仁慈，因此李自成决定将崇祯皇帝葬入明十三陵。
一般皇帝生前都会为自己修建陵寝，但是崇祯皇帝并没有来得及为自己修建陵寝，所以崇祯皇帝的安置之处就成为了一个问题。找来找去，也只好是将崇祯葬在他妃子的墓里，由于当时没有多少钱，下葬所需钱还是募捐而来，一共才募捐350千文，就这样才完成了崇祯皇帝的下葬。
后来，清军入关之后，为收买人心，笼络汉族大臣及前朝遗老，顺治皇帝下旨重新修建了崇祯陵寝，营建了地上建筑，也就是现在我们看到的"思陵"。在改造过程中，降清的前明将领吴三桂捐银千余两帮助修建思陵。
