当时，清朝共设有12名陆路提督和3名水师提督（福建水师提督、广东水师提督及长江水师提督）。虽然在名义上，提督是受总督管辖的，问题是，提督的官阶却是从一品，这比不加衔的正二品总督要高一个级别，即便是和加衔的总督比，也是平起平坐。
更关键是，提督也享有单独奏事权，遇事可直接上奏皇帝，这也就导致总督其实是很难真正有效控制提督的，两人本质上是相互制约。在这种背景下，总督虽然是地方最高军政长官，但他在地方上的军权，实际上是要受到提督的制约。
第三，也是最重要的，清朝的中央边防军是不受总督控制的，甚至都不是它能够染指的。在清朝历史上，共设驻防将军十四人，分别驻守盛京、吉林、黑龙江、绥远城、江宁、福州、杭州、荆州、西安、宁夏、伊犁、成都、广州、乌里雅苏台。
这四十个将军，统率的都是清朝最精锐的八旗驻防军，因此他们也被称之为旗兵最高长官，其官阶除绥远将军和伊犁将军是正一品外，其他都是从一品。
