在攫取权力、培植党羽的同时，太平公主也意识到侄儿的危险性，为了能将他扳倒，便屡次在唐睿宗面前大进谗言，希望能阻止李隆基被立为太子，并将自己中意的李成器（睿宗长子，曾做过太子）捧上储位。然而李成器看穿了姑妈的用心，并不甘心做她手中的傀儡，便极力推荐由弟弟来做太子，并得到唐睿宗的首肯，使得太平公主的图谋破产。
李隆基成为太子后，跟姑妈间的矛盾变得更深，唐睿宗因为无力进行调节，便将皇位传给儿子，时在先天元年（712年）八月。唐玄宗的即位让太平公主极度恐慌，为了防止他削夺自己的权势，便常与亲信窦怀贞等人密谋，准备派羽林将军常元楷和李慈从北面、以南衙兵从南面起兵夺权，甚至还想串通宫人将皇帝毒死。
太平公主等人的异常举动引起唐玄宗的警惕，为了防止他们率先起事，便与心腹郭元振、王毛仲、姜皎、高力士等先发制人，率五百羽林军闯入虔化门，先是传召常元楷和李慈并将他们杀死，随即在内客省捕杀贾膺福、李猷，在朝堂上捕杀宰相萧至忠、岑羲。窦怀贞闻变后自杀，随即被唐玄宗下令戮尸。经此一遭，太平公主在朝中的党羽被悉数铲除。
政变发生后，太平公主仓皇地逃入山寺避难，直到三天后才回到府邸，并派人向唐玄宗上书乞求活命，但遭到拒绝。紧接着，唐玄宗以太平公主"谋逆"的罪名，下令将其赐死于府邸当中，并诛杀了她的三个儿子薛崇训、武崇敏、武崇行，唯独宽恕了因经常劝谏母亲而遭鞭打的薛崇简。太平公主汲汲营营一生，最终却落得被灭门的下场，实在是令人唏嘘。
史料来源：《旧唐书》、《新唐书》、《资治通鉴》
