公元618年武德元年，李渊在长安称帝，建立唐朝，当时虽然依旧是群雄割据，但是唐朝的实力已经是天下群雄之首了。所以李渊决定要逐一消灭这些带头大哥，统一全国。同年十一月，屈突通跟随李世民干掉西秦政权后正要打算进攻中原，刘武周却没有眼力见地率军南下。于是公元619年武德二年，李世民率军进攻刘武周，当时刘武周大败后部将纷纷投降，其中就有尉迟敬德，但是后来很多投降的部将又都叛唐，所以屈突通就认为尉迟恭这黑鬼也心怀不轨，多次建议李世民干掉他，索性李世民没有听他的，不然就失去一名大将了，不过李世民也知道屈突通是出于忠心，两相较下还是很感动的。
平定薛举、刘武周后，割据势力种最强的就剩下河北的窦建德与河南的王世充。公元619年武德二年七月，李世民率军向东进攻王世充，当时的屈突通早就是李世民手下的大将，自然随军出征。在兵强马壮的唐军攻势下，王世充节节败退，并在屈突通多次率领大军冲击下之下大败。公元621年武德四年，王世充在洛阳周边布下的大军在屈突通和李世民的配合夹击下击溃打散，无奈之下王世充只好退守洛阳据城不出，并且北联窦建德打算南北夹击唐军。但是王世充和窦建德似乎都小看了李世民，李世民是什么人，一个下得了狠心杀兄屠弟的人，还怕这个？因此采用围城打援，令屈突通同李元吉继续围困洛阳，防止王世充趁机骚扰，自己率领大军去打窦建德。同年五月，在虎牢之战种李世民大败窦建德，与屈突通合兵一处兵临洛阳城下，王世充一看没戏了，于是就投降了，而当时唐朝也基本上完成了统一。作为立下大功的屈突通，被封为右仆射，不久后回京工作被封为工部尚书。
