二是崇祯执政期间，自然灾害不断，也就是著名的明朝小冰河时期。自崇祯元年起，中国北方大旱，春草不生。《汉南续郡志》记载："崇祯元年，全陕天赤如血。五年大饥，六年大水，七年秋蝗、大饥等。陕西年年有大旱，百姓流离失所。"没有吃的，百姓就争相挖山中的蓬草、树皮吃，到后来只能吃观音土，最后因腹胀而死。十七年间，被饿死的百姓数不胜数。到处都是堆积如山的白骨，百姓死后都没有人处理其遗体。北方大旱，江南却出现了洪灾。洪灾、旱灾、蝗灾等灾害，对百姓来说是巨大的考验。
三是除了旱灾、蝗灾，还有瘟疫，而且是烈性传染病。崇祯十三年，顺德府、河间府和大名府均爆发了大瘟疫。次年，疫情进一步扩大，从河北地区传到了京城。崇祯十六年夏秋间发生的腺鼠疫，到第二年春天转化为肺鼠疫。北京城内的百姓死亡率在百分之四十以上，十室九空。全国其他地方，也在爆发瘟疫。据不完全统计，万历和崇祯年间的两次鼠疫大流行中，华北陕、晋、冀3省死亡人数至少在千万人以上。
四是战乱不断。自然灾害和瘟疫的流行，让地方政府处于十分脆弱的状态，盗匪与流民并起，各地民变起义不断爆发。其中，最著名的就是李自成的起义军。虽然崇祯帝多次派兵围剿流寇、镇压起义，但收效甚微。此时，满清势力不断骚扰入侵。朝廷苦于两线作战，每年的军费支出高达两千万两白银以上。但国库早已入不敷出。缺乏军饷，导致明军内部不断发生骚乱哗变。
可以说，当时明朝是内忧外患。种种原因之下，明朝最终走向了灭亡。
