该来的还是来了，随着武昌起义第一枪的打响，黎元洪一时间被推向了风口浪尖。起义成功后，革命党人群龙无首。为了稳定形势，巩固来之不易的革命成果，革命党人把目光投向了既有威望又和革命党过从甚密的黎元洪。
此时的黎元洪早已被吓得瘫作一团，据说革命党人是从桌子底下找到黎元洪的，而面对前来的革命党人，黎元洪的第一反应是自己要被杀了，从他口中说出的三个字是"莫害我"。当得知革命党人是要推举他为湖北军政府都督后，黎元洪依然表现出犹豫不决的态度，直到汉口、汉阳光复，各国领事宣布"中立"，他才宣告就职。
军政府大都督、大元帅的黎元洪面对清政府的全力围剿，形势一度十分危急，此时袁世凯的出面调停为黎元洪带来了一线生机。袁世凯从自己的利益出发，扮演起了清政府和革命党之间的"和事佬"角色。黎元洪对袁世凯的"出手相救"十分感激，他称赞袁世凯"胸怀磊落，名满天下"，表现出对袁世凯的推崇之情。与此同时，对于刚成立的南京国民政府和临时大总统孙中山，黎元洪却表现冷淡甚至不满，这更加深了黎元洪双面、复杂的形象。
在袁世凯成为中华民国大总统后，黎元洪当选为副总统。他以"前兼领湖北都督"的名义领衔各省都督、民政长联名通电， 主张遣散议员，解散国会，以政治会议取而代国会，实际上为袁世凯恢复帝制铺设了道路。
