所以，在朱聿键的整顿下，南明军队终于出现了少有的攻势，一度曾收复了旌德、宁国等失地。可惜，就在此刻，郑芝龙却产生了摇摆之心，想投降清兵，因此拒不出兵支援和提供军粮等，使得这次攻势，最终无功而返。
如此，便是一年后，清兵攻击福建，朱聿键已是束手无策了，因为他手中无兵。黄道周临危受命，出外募兵，被清兵俘获最终被杀。朱聿键眼见事态危机，再也不顾郑芝龙的阻挠，亲率数千明军，准备打向湖南。哪料郑芝龙却在此刻，投降清兵，出卖了朱聿键，使其在汀州被清兵俘获。
被俘获后的朱聿键依然保持着，大明天子的刚硬，誓死不屈。至于最终是如何死去的，出现了两种说法，一种是朱聿键，绝食死于福州的大牢内。
另一种说法则是在清兵攻克汀州后，朱聿键战至最后，退守于汀州城衙的大堂中，最终被清兵乱箭射死，同时被射杀的还有，他的皇后曾氏、沈嫔、陈嫔及不满月的皇子。
但无论怎样，显然朱聿键虽只做了一年帝王，却堪称是大明最后脊梁--可以赴死，却绝不下跪；可以失败，却拒不认命。
