明军攻下曲靖后，兵分两路，一路由傅友德率领，向北杀向乌撒，接应永宁来的胡海和郭英等大军；一路由蓝玉和沐英带领，直捣昆明城。
昆明城中的梁王闻讯，赶紧派人向大理总管段世求救。段世与梁王关系不好，同时也出于保全自己的考虑，选择了按兵不动。梁王见大势已去，又不想投降朱元璋，于是，选择自尽而亡。
接下来，明军以秋风扫落叶之势，迅速平定云南全境。
1384年，云南的局势已经十分安定，朱元璋才命令蓝玉、傅友德班师回朝，留下了沐英镇守云南。
明军大部退走后，云南陆陆续续又发生几次小规模叛乱，但在沐英的指挥下，很快得以平定。
1389年冬天，沐英回南京述职，朱元璋亲自设宴招待，奖励他黄金两百两，白银五千两，然后命他继续返回云南镇守。离京时，朱元璋拉着沐英的手，亲切地对他说：最能让我高枕无忧的，就是我儿沐英了，此去云南，多多注意。
沐英深感皇恩浩荡，返回云南后，一边收复土司各部，一边兴修水利，发展生产。他在云南因地制宜，制定一系列的规则，使百姓安居乐业，而且每年向朝廷缴纳大量税金。
