如此一来尚书省就成了主要的中央权力机构，到了东汉末年，尚书令拥有更多的权力，几乎包揽了朝中的一切政务，甚至一度造成"三公"（即司徒、司空、太尉）完全失去实权。到了魏晋南北朝的时候，由于权力衰微，"三公"甚至不经常设置。
其后尚书令继续得势，权力继续加强，与此同时，权力得到强化的还有中书令和侍中。到了隋朝以后，朝廷正式建立了"三省"。至此，我国历史上一个新的中央官制诞生了。
到了唐朝以后，三省制度不仅得以延续，而且更加完善。此时三省得到更加详细的划分和界定，同时三省的长官，其权势和地位也各有不同。尚书令不仅在官位品阶高出另外"两省"长官一品，而且还直接管辖六部，负责政策的具体执行。
唐高祖李渊在位的时候，李世民就一直担任尚书令这一官职。当时李世民的地位超过了满朝文武，后来甚至走上夺权之路。由此可见，尚书令这一官职掌握着极大的权力。
