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"楚国公造反了"，消息从本土越过长城传遍四方，给征辽军带来了心理上的重大打击。炀帝得知玄感谋反也无心再在辽东逗留。赶忙撤回辽东诸军，以屈突通为前锋和樊子盖卫文升合力攻击杨玄感。
眼看敌军四至，再拖下去就要陷入重围，李子雄与李密劝杨玄感放弃洛阳，西行抢先一步夺取关中，再以关中为基地争夺天下。杨玄感听从意见西行入关，但是为时以晚，终于在皇天原为隋军主力所败，身死名裂。
隋廷虽然倾力剿灭了这次叛乱，但是第二次征辽之役却也因此半途而废。
跟杨谅事件一样，杨玄感事件的牵连也很广泛。当初杨玄感攻击洛阳的时候，隋朝很多达官贵人的子弟都投靠了杨玄感，.其中就知名的就包括韦世康之侄韦福嗣，韓擒虎之子韩世谔、觀王杨雄之子杨恭道、虞世基之子虞柔、來護兒之子来淵、裴蘊之子裴爽、大理卿鄭善果之子郑儼、周罗睺之子周仲等四十餘人--这些人战后一般都受到了通缉，有不少被处死的。。炀帝穷治其党羽，前后所杀累计三万多人，甚至杨玄感开仓放粮之时从粮仓领取过粮食的洛阳周边百姓，一经查出都要坑杀。
