第1点是胡惟庸谋反案发生在公元1380年的正月，而李善长被杀则是公元1390年的5月。前后相差10年时间。若李善长为胡惟庸谋反的同谋，为何当时不处理呢？反而要过10年才想起来处理呢？
第2点是李善长谋反的动机不足，李善长聪明过人，在朝堂长袖善舞，深通政略，应该比谁都清楚谋反意味着什么。如果他真想做皇帝，那么应该在元末天下大乱的时候自立山头，何必要辅佐朱元璋呢？如今朱元璋已经做了皇帝，天下已经太平了十多年，这时候去搞谋反，不是自找死路吗？
第3点是说李善长助胡惟庸谋反篡位，这个罪名更加立不住，原因是李善长在朱元璋这里已经贵为左丞相位极人臣，儿子也作了驸马爷，能得的好处基本都得到了。那么帮助胡惟庸做皇帝，就算侥幸成功，胡惟庸到时候也不过封他个左丞相。既然谋反和不谋反的结果是一样的，那又何必提着脑袋去冒风险呢？
也正因此，李善长没有谋反的动机，也没有谋反的必要。所以他被杀后，有一个小官就针对此事，给朱元璋上了一道折子，为李善长鸣冤叫屈。按照朱元璋的性格，定是龙颜不悦一怒之下斩了那小官，但结果很可疑，朱元璋不但没有发怒，反而也没有处理那小官，总之闭口不提此事，闭着眼装糊涂，什么也没做。
