关键时刻叛变，天京再次陷入危机，李秀成只好联合陈玉成反攻，试图重新夺回城池，保住江北基地。当然，薛之元也不好对付，陈玉成、李秀成猛攻，也只能夺回浦口，江浦、九洑洲则继续在清军手中。投降清朝后，薛之元继续镇守江北地区，配合和春、张国梁版"江南大营"围困天京，冲杀在最前线。1860年春季，陈玉成、李秀成采取"围魏救赵"之计，再次摧毁"江南大营"，和春自缢而死，张国梁则落水而亡。薛之元呢？见"江南大营"崩溃，自己处境孤立，于是连夜撤出江浦、九洑洲，逃往安徽。撤退途中，2万余大军因清朝长期拖欠饷银而发生哗变。为此，薛之元干脆再次反清，劫掠官银，以充军需。为了保住性命，他再次联络李秀成，希望能给太平天国效力。
薛之元准备再次投奔太平军，但半路被清朝提督李若珠7000兵马击败，全军在高邮溃散。此时，薛之元带着老婆、孩子，一家3口一路乞讨，昼伏夜出，来到了滁州李昭寿军营。李昭寿呢？好吃好喝款待，许诺帮他脱险。谁知，这是李昭寿之阴谋。为了表示对清朝之忠诚，以获取更多利益，李昭寿将薛之元一家全部处死，并将其首级割下来，送给胜保。当然，李昭寿下场也很惨，平日作威作福惯了，回到老家还不收敛，在公开场合打残贡生吴廷鉴。为此，清朝安徽巡抚裕禄大怒，将其斩首示众。
参考书目：《太平天国战争全史》、《天国志》
