隆庆开关的局限主要表现在以下四点： 一是从开放的港口来看，当时仅限于福建漳州月港（今福建海澄）一地；二是中国海商通商的地点也有限制，尤其是日本，禁之特别严厉；三是对海商经营的物品也有限制；四是对海商出海的数量也有限制。船只必须先取得船引后方能出海，而政府每年发放的船引总量却又少得可怜。由此可见，从出海船只到贸易路程，从出海时间到贸易货物，明朝政府都有严格的限制。这样，中国海商在海外贸易与西洋商人的角逐和竞争中，就处于十分不利的被动局面。但是，在明朝民间的私人海上贸易却一直没有禁绝。
隆庆开关的原因
明朝对海外贸易的管理实行的是双轨制，对朝贡贸易和私人海外贸易是采取不同的管理措施。其中对朝贡贸易实行鼓励政策，对私人海外贸易实行限制和打压政策。这是为什么呢？
明朝建立后，由于北方的蒙元残余势力仍然很强大，为了专心对付来自北方的威胁，朱元璋对周边各国都奉行睦邻友好政策。再加上，明王朝为了显示其正统性和合法性，更想建立一个"四夷来王，万国朝宗"的盛世场面。于是，多次派出使臣出使南海诸国，要求"称番纳贡"，以示笼络。
