这些节度使不仅拥兵自重割据一方，而且想要干预朝政，挟天子以令诸侯。李茂贞曾数次攻进长安威胁唐昭宗，韩建在唐昭宗出逃河东的路上将其虏到华州软禁了起来，以此干涉朝政。他为了削弱皇室的力量，将唐昭宗的亲军解散，又污蔑覃王李嗣周、延王李戒丕等谋反，而矫诏将包括李嗣周、李戒丕等十一王并他们的随从、侍者赶到石堤谷，全部杀害。
好不容易唐昭宗被放回了长安，结果又有一场大灾难等着他，900年，神策军两中尉刘季述和王仲先联合发动政变，将唐昭宗囚禁在少阳宫，扶立皇太子李裕为帝，又一场杀戮在宫中进行。《新唐书》载：季述等皆先诛戮以立威，夜鞭笞，昼出尸十辇，凡有宠于帝，悉榜杀之。杀帝弟睦王。
他们大开杀戒，在夜里大肆杀人立威，然后在白天将尸体分十辆车运出去，唐昭宗的弟弟睦王李倚也被杀死。而不久后，宰相崔胤求助于朱温，最终复立已经成为太上皇的唐昭宗为帝，刘季述护卫王仲先等数十人都被杀死。
而不久，宦官们逼迫唐昭宗逃到了李茂贞的地盘凤翔，朱温派兵围攻凤翔，持续了一年多，凤翔城很快断粮，百姓大量饿死，最终李茂贞支撑不住，将依附于他的二十多名宦官杀死送给朱温求和，并将唐昭宗交给了朱温。
