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朝廷的回复说得已经非常明白了！“总督衙署重地，竟有凶犯胆敢持刀行刺”，背后究竟是不是有什么人支持，这才是朝廷要弄明白的。说来也巧，最让人担心的局面出现了......
朝中开始有人借此案，胡乱添油加醋，公报私仇。
两江总督衙门户科给事中上奏称：张汶祥行刺之时喊过：“养军千日，用在一朝！”这分明就是有人指使！这一消息可谓惊天秘闻，在朝中一下子炸了锅。
太常寺少卿王家璧上奏传闻：“江苏巡抚丁日昌之子被案，应归马新贻查办，请托不行，致有此变。”
一下子把漩涡中的江苏巡抚丁日昌扯了出来，针对丁日昌的攻击开始了。不仅如此，还把丁日昌的儿子也一并牵出。王家璧说的是什么案子呢？
不久前，丁日昌的儿子和亲友在太湖游玩，碰见太湖一兵丁，两人起了争执，正巧兵丁上司来到，惩罚了兵丁。世后，兵丁竟一命呜呼。这个案子交由马新贻审理。总督审巡抚儿子的案子，而且说到底也无什么责任，马新贻自然卖个面子，简单处理。在此过程中，丁日昌表示自己教子无方，并要求严加法办。事情迅速解决，并没有出现太常寺少卿王家璧所说的情况。
朝廷简单查证，便知此说不值一提。
但是这对于丁日昌并不是什么好消息。
原因很简单：作为湘军出身，后投淮军的丁日昌被人盯上了。
“请托不行”这盆脏水便是前站。太常寺少卿王家璧为什么也非湘军出身，为什么要泼这盆脏水呢？丁日昌是铁杆的洋务派，被朝中守旧派记恨已久，今有良机，有枣没枣打三杆子。
案发之时，丁日昌究竟在哪呢？
7月25日，也就是“刺马案”前一天，江苏巡抚丁日昌来到天津，会见了正被“天津教案”折磨的曾国藩。7月26日，“刺马案”发生，而也就在这一天，曾国藩回访丁日昌。
丁日昌的天津之行，究竟与“刺马案”有何联系，丁日昌究竟与曾国藩说了什么，引来外界种种猜测。开始有传闻说：马新贻被杀，终究是因为与巡抚丁日昌关系不和。虽然朝廷确认上次是诬告，但是这个复杂的大锅，丁日昌可是背不起的。
这样的传闻可是吓坏了丁日昌，虽然脱离了湘军，但是也算是和平分手，如果还是顽固派倒也好说，最怕是湘军势力故意利用此事报复自己，做一个代罪羔羊？越想越害怕的丁日昌，想到了自己唯一的救命稻草曾国藩。
他上书朝廷，希望让曾国藩来江宁调查此案，又写信给曾国藩，希望他能来江宁审理此案。
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得到朝廷严加审讯指令的江宁将军魁玉，怎敢耽搁，立刻用刑。这一用刑，张汶祥还真就招认了，立刻供出自己曾经参加过捻军，还把自己的儿女招了出来。至于是什么人指使张汶祥干的，还是毫无所获。
魁玉审理将近一月，竟然毫无所获，这让朝廷大失所望，朝廷下旨：
“惟以兼圻重臣，督署要地，竟有不法凶徒潜入署中，白昼行刺，断非该犯一人挟仇逞凶，已可概见。现在该犯尚无确供，亟须彻底根究。著张之万驰赴江宁，会同魁玉督饬司道各员，将该犯设法熬审，务将其中情节确切研讯，奏明办理，不得稍有含混。”
朝廷的“白昼行刺，断非该犯一人挟仇逞凶，已可概见。”已经确定了，这件事绝不是张汶祥意气用事，而是有准备有组织有预谋，而这个背后的黑手是谁呢？
魁玉查不出来，那么就让漕运总督张之万前来牵头会审。
朝廷的方针是一贯的“设法熬审，务将其中情节确切研讯。”朝廷既然想用此事大做文章，得不出好结果，朝廷自然不会满意。
张之万何许人也？张之万是张之洞得哥哥，河北南皮人，慈禧太后得铁杆支持者，在辛酉政变中就支持了慈禧太后，还得到过醇亲王的推荐。更重要的是，张之万既非湘军，亦非淮军，只是效忠慈禧。
既然魁玉不给力，张之万被朝廷赋予重任，一定要把幕后黑手查出来，得到朝廷想要的答案。朝廷想要什么答案呢？
这时的大清可谓是派系林立，各方势力错综复杂。朝内就有后党与奕訢两党之争，朝中还有以奕訢为首的洋务派与顽固派的矛盾。在洋务派中又分为满人与湘军。
湘军历尽千辛万苦，解决了太平天国之乱，太平天国所控制的江南地区，基本被湘军把持。虽然曾国藩主动裁撤湘军，但湘军大员已经遍布各省督抚，却是一个不争的事实。
