吕布与董卓之间的矛盾和冲突，被一直想除掉董卓的司徒王允察觉。王允故意拉拢吕布，而此时的吕布也希望通过王允结识朝中的实力派人物，两人便很快成为朋友。在王允的劝说下，吕布终于下定决心与王允一起铲除董卓。
献帝初平三年（公元192年），吕布利用董卓疏于防范之际，在长安成功诛杀了董卓。得知董卓被杀的消息后，长安百姓载歌载舞，争相庆祝，汉末朝廷也终于出现了复兴的曙光。由于吕布的巨大功绩，汉献帝下诏，任命吕布为奋武将军、假节、仪同三司，并封为温侯。奋武将军虽为杂号将军，但却相当于汉代官军的总监军，地位崇高。假节，是汉末三国时期皇帝授予臣子的一种权力，拥有斩杀违反军令的中级官吏的权力。仪同三司，指的是未能担任三公而享受三公的礼仪待遇。温侯，高于都亭侯，是汉代爵位的一种，是县侯，具体地点是在河内郡的温县，也就是三国中期大名鼎鼎的曹魏权臣司马懿的故乡。
不过，汉献帝对于吕布的重视并未能改变司徒王允对吕布的看法。王允认为吕布只不过是一名剑客，从心里看不起吕布，拒绝采纳吕布提出的建议。而吕布却认为自己立下大功，理应得到王允等人的尊重，因此两人的矛盾不断加剧。尤其在如何处理董卓残部的问题上，两人的立场针锋相对，这种将相不和的现象导致了决策上的犹豫不决，并最终引发走投无路的董卓残部拼死一搏。
就在董卓被杀两个月后，以李傕、郭汜为首的董卓残余势力向长安发动进攻。经过十余天的战斗，终于攻占了长安。随着王允被杀及汉末朝廷被李傕等人所挟持，汉末政局从此陷入万劫不复的境地。在这场混战中，吕布逃出长安，开始了长达七年的漂泊岁月。
逃出长安后，吕布首先去投靠袁术，但遭到袁术的拒绝。无奈之下，吕布只得转而投靠袁绍。此时的袁绍外有公孙瓒的入侵，内有张燕的袭扰，对于吕布的前来非常高兴，便收留了吕布。不久之后，袁绍命吕布率部向张燕所占据的黑山地区发动进攻。经过一番血战，吕布重创张燕，终于稳定了袁绍占据的冀州地区的局势。
