这种在战时筹措军费的存留裁扣，在康熙二十年统一战争结束后，部分得到恢复，存留在赋税总额中所占的比列也开始上升。但存留部分较裁扣数额差距仍然很大，这种情况自此沿袭下来，使得起运与存留的比例在清代进入承平时期以后一直保持严重的不平衡状态。
据学者研究，明万历年间，全国总存留数，约占全国总收入的42%，而清乾隆年间，全国总存留仅占全国钱粮总收入的21%左右。可见清代中央政府在赋税收入的分配方面坚持实行中央集权。
耗羡归公的财政改革以后，存留和起运发生的变化
雍正二年，清政府实施耗羡归公的财政改革，这是改进清初以来存留和起运比例的一个重要步骤。清初军费浩繁，裁扣地方存留收归中央，地方原来的经费开支因为紧张。中央政权既然不因事设费顾及地方，地方官又不能因无费而不理事，于是便另谋其他的筹资途径。
