不过秦琼老了之后，错失了一个机遇，让他被程咬金远远甩开了，这就是"玄武门之变"。因为在这件事中，程咬金是最先声援李世民，让他起事的，而且在这件事中出了大力，让李世民登上了皇位。
而反观秦琼，因为当时的他身体不太好，这件事中没有做什么大的帮助，只是出了一些胁从的工作，因此李世民上位后，自然就是重用了程咬金，而且别看电视剧中的程咬金是傻傻的样子，其实历史上的他是一个很有心计的人。
接着这件事的功劳，程咬金受到了李世民的提拔，在李世民在位期间，可谓是军权在握，而更重要的是，李世民死后，他又辅佐了李治，为李治顺利上位提供了帮助，这让平时就很尊敬程咬金的李治对他也是非常的器重和信任。
武则天立后期间，程咬金又是为数不多什么话都不说的，而且一心支持李治的做法，这既得到了李治的进一步信任，也得到了武则天的人情。而再反观秦琼，从开国战争结束后，他就身患疾病，久久没有康复，贞观12年就病逝了。
