此外，元朝有着远超南宋的海军力量，退守台湾也只能成为"瓮中之鳖"。
元朝虽然是靠着蒙古铁骑称霸天下，但其在征服过程中，不停的收编部队，其中就包括了南宋强大的水师。后来的崖山海战中，击败南宋朝廷的其实就是投降元朝的南宋水师。
当时南宋流亡政权，四处收集各类船只，最终只弄到包括渔船在内的大小近千艘船只。数量和质量远远达不到需求。元朝虽只有500艘船，但其船舰都是清一色战舰。雪上加霜的是，泉州阿拉伯裔商人蒲寿庚又将自己上千艘船只无偿献给元朝。
对比南宋这边，南宋的流亡政府虽然号称有十万人，但是这十万人有一部分是由老弱妇孺组成，他们在短时间内根本无法形成强大的战斗力。在这种情况下，如果南宋政府登陆台湾，那么元朝的大军很快就会将台湾岛围住，再加上岛内资源有限，南宋所能坚持的时间必然不会长久。
