严世蕃于是以工部左侍郎的头衔，行使内阁学士的大权。每日处理百官奏折，做出批注，然后呈给皇帝。
上文已经说过严世蕃善于揣摩上意，所以他做出的批注很讨嘉靖帝的喜欢，于是严嵩干脆让严世蕃代自己入值，将所有事务都交给严世蕃处理，而他专心陪侍嘉靖帝。
严世蕃因为父亲的放权，一时间"权倾天下"。他为人贪得无厌，在可以对官员的升迁进行干预之后，就将此当做筹码，大肆收受贿赂。严嵩想必也知道此事，但对此却视而不见。
以巨额贿赂严世蕃的官员，官途一帆风顺，未曾做出表示者，往往被严世蕃降职位。如此明目张胆，自然有人弹劾，但可惜严家父子深受帝宠，影响不大。
