这一次，崇祯帝也伤心了。满清的大军一路杀到了山东，并且俘虏了宗室藩王，脸面都丢尽了。崇祯帝一开始也采取了一些措施，一方面急调辽东总兵祖大寿入援；另一方面任命总督宣、大、山西军务的卢象升率师抵抗，并命令卢象升督天下援兵。但卢象升能指挥的兵马不到两万人，后再河北巨鹿被多尔衮和岳托的大军全歼，卢象升战死。
主战派 卢象升 卡通
对于这件事，杨嗣昌是主张与清朝和谈的，至少不能将朝廷的有生力量一步一步放在这个战场消耗。杨嗣昌一再告诫崇祯帝，攘外必先安内，农民起义军是心腹之患，不可不除；清廷是“肩臂”之疾，不会要命。满清作为异族，只有几万的兵马，虽然训练有素、战斗力强，但毕竟人数少，成不了大气，当务之急是先与清朝和谈，稳住京师的局势；然后，一心一意，一鼓作气彻底剿灭农民军，扫除干净，不留后患。
这一次，崇祯帝没有听信杨嗣昌的。多尔衮、岳托大军撤退后，崇祯帝将在陕西担负镇压农民军重任的洪承畴和孙传庭等人调往辽东防范清军。孙传庭和杨嗣昌想法一样，不能将陕西的军队全部调走，至少孙传庭自己的“秦军”应该留在陕西，以便扫清农民军，保持威慑力。后来孙传庭被崇祯帝关进大牢。
崇祯帝或许基于两个原因考虑：一个是清军前几次都是在北京附近抢掠，这次竟然到了山东，再不采取措施，真不行了；二是陕西的农民起义军基本被扑灭，可以腾出手来对付清军了。就是这个关键的一步，将大明朝彻底葬送了。
朝廷大军调走后，李自成在大山之中得以喘息；张献忠也蠢蠢欲动。崇祯十二年（1639年），张献忠在湖北襄樊再次起义；李自成从商洛大山率几千人马杀出，正好遇上河南大饥荒，起义军兵源充足，李自成的军队很快发展到十数万人，并提出了“均田免赋”的口号；张献忠率部队在湖北、湖南、江西横冲直撞，一时间也聚集了十数万大军。
一两年时间，形势就变成这样糟糕。崇祯帝大惊失色，命令杨嗣昌以“督师辅臣”的身份前往南方围剿张献忠的农民军，一开始小有战绩，在四川玛瑙山大败张献忠的农民军。张献忠于崇祯十四年（1641年）从四川杀个回马枪，率大军奇袭湖北重镇襄阳，攻破襄阳城，在襄阳就藩的襄王朱翊铭被张献忠杀死。杨嗣昌听到这个消息后，悲愤交加，自杀身亡，享年54岁。藩王府被攻破，亲王被杀，这个叫“陷藩”，死罪。杨嗣昌死后，崇祯帝给了他莫大的哀荣，可是又有何用呢？
