莽古尔泰听完皇太极的话后，便与皇太极争执了起来，这次皇太极并没有治莽古尔泰的罪，只是让莽古尔泰先回去反省一下。可是没过多久，莽古尔泰却又犯了错误，不仅态度蛮横，而且没有一点悔改之意。
而且，莽古尔泰这次的行为还更加恶劣，说到激动处，更是掏出了匕首，皇太极见莽古尔泰如此的无理，十分生气，命人将莽古尔泰带下去，交由诸位贝勒议罪，最后诸位贝勒定了莽古尔泰一个不敬之罪，定完莽古尔泰的罪后，先是皇太极将莽古尔泰囚禁起来，后来又将莽古尔泰的和硕贝勒降为多罗贝勒，莽古尔泰所统领的正蓝旗，被削去一大部分交由莽古尔泰的亲弟弟德格类统领。
公元1632年，莽古尔泰不知因何原因，重新得到皇太极的起用，跟随皇太极出征，在战争取得胜利后，跟随皇太极班师回朝。但是这之后仅仅过了一年，莽古尔泰就去世了，终年四十八岁，关于莽古尔泰的死因，一直众说纷纭。莽古尔泰去世后，皇太极亲自去府中祭奠。
如果说莽古尔泰的真正结局到此的话，那还算是相对比较好的一个结局。然而莽古尔泰的结局却并没有止步于此，在莽古尔泰死后的两年，莽古尔泰亲妹妹的属下，告发莽古尔泰和德格类还有亲妹妹莽古济，曾经在府中密谋夺取汗位之事。
事实上兄妹三人也确实曾有过密谋，只不过这三个人当事人，当时只有莽古济还活着，剩下的两人早已去世。加上还有莽古济的丈夫作为证人，皇太极又搜到了刻着大金皇帝的玺印，莽古济自然难以辩白。
