当晚多铎到了南京城，在天坛安营。天色还没黑透时，由钱谦益主导，赵之龙打开城门投降。刘良佐也被活捉，主动提出来去捉拿朱由崧赎命。
最终黄得功战死，朱由崧被两名降将背着投降了清兵。当他坐着小轿和皇后重回南京城时，身前身后全是清兵押送，目睹此景，南京城内的“百姓夹道唾骂”，还有人向轿内投打瓦砾。
朱由崧被押到多铎的面前，有清兵喝令跪拜，朱由崧只好照做。多铎颇为得意，命人设宴款待朱由崧，投降的各官吏也都作陪。酒至半酣，多铎向朱由崧发出四连问：
一问：你先帝崇祯有太子，你不奉遗诏拥戴，自己却做了皇帝，这是为什么？
二问：你既已擅自继位，只是纵情于酒色，听信奸臣纳贿行贿，不派一兵一卒收复失地，这是为什么？
三问：你先帝有太子，逃出京城来投奔你，你不让位，反而认为是假太子，关进监狱准备处死，于心何忍？
四问：我的兵马还在扬州，你为什么就望风而逃？
多铎四连问后，朱由崧汗流沾襟，无一言可对。宴席结束后，被关押在南京城的江宁县署。多铎让南明旧臣去探望，只有两人前去，其他官员全部拒绝。而朱由崧见到来探望的两人，嬉皮笑脸，只是询问“马士英何在？”
5、朱由崧是阿斗附体
朱由崧不是赵构，江北四镇也不是韩世忠、岳飞，同样偏安于江南，赵构“恭俭仁厚”，虽然没有收复失地的才能，但是“继体守文”绰绰有余。保持武备的情况下，又通过绍兴和议赢得宝贵的喘息机会，从而保证了南宋没有迅速走向灭亡。
朱由崧则是阿斗附体，正如史可法所说的“不读书”，无法完成战略性政治和军事规划，对外依靠一介文人史可法、骄奢难驭的四镇，对内依靠庸才马士英、阮大铖。天天宴饮不休，“娈童季女方药纵欢”，一如阿斗附体，以马士英、阮大铖的能力，哪里可能中兴南明？
