都指挥使司以下的州府一级，则设立“卫”，每个卫五千六百人。州府以下的郡县，设立“所”，每个所一千一百人。而都指挥使司能够管辖的兵员数量，跟辖区内“卫所”数量，有直接关系。
虽然每个都指挥使司下管辖的兵员数量都有数万人，但并不是完全相同，没有一个标准数字。纵观整个明朝历史，不同时期的兵员数量是不同的。明朝初年的时候，兵员数量可以位置在一两百万人之间。
但是，到了明朝中期，嘉靖年间，时任吏部尚书桂萼公布了兵籍数量，仅为97万。因为到明朝中期的时候，出现很多士兵逃亡的现象，直接导致兵员数量下降。
这两个不同时期兵员数量的不同，自然会导致都指挥使司数量的不同。即便是同一时期，不同地区都指挥使司的兵源数量，也是不同的。
一般而言，边地兵员数量会多于内地。因为边疆地区更容易爆发战争。把时间放在明朝初期，当时的陕西都指挥使司管辖着33个卫所，而浙江都指挥使司只管辖20个卫所。
