然而，好景不长。1940年6月7日，法国战败投降后关闭了滇越铁路，滇缅公路成了中国获取外援的重要通道。但英国却在7月17日与日本达成《英日关于封闭滇缅公路的协定》，断绝了这条"生命线"，使中国军民失去了物资补给的国际支持，极大削弱了中国的抵抗力量。直到当年9月27日，德、日、意在柏林结盟，英国战时内阁才于10月3日决定滇缅公路封锁到期后不再延长封锁，于10月18日重新开放。
随着日本侵略魔爪伸向东南亚直接向英国"开火"，英国才终于决定与中国开展合作保护其远东利益，并于1940年底向中国提供1000万英镑贷款，但同时通知中国政府不能提供武器和军事人员，只是口头许诺将考察未来可能合作的基础，提高驻华军事武官的地位，扩大其武官处等。
（图为英国前首相丘吉尔，他上台后虽一改绥靖政策，但在中国抗战问题上却没少在背后下绊子）
英国援华行为的动机，丘吉尔在1941年11月发给罗斯福的电报中说得明白：
我们所焦虑的就是中国，如果他们崩溃，我们共同的危险将会大大增加。
中国的抵抗一旦崩溃，不但就其本身来说是一场世界性的悲剧，而且也会让日本人腾出大量军队来向北或向南进攻。
1942年2月16日，第1期中国远征军根据中英两国政府达成的协议入缅作战。但英国方面对中国军队进入其控制的殖民地，是怀有深深戒心的，因此在联合作战中频频下绊子，甚至拿中国远征军当英军的"垫脚石"。这种行为直接导致了缅甸战役的迅速失败。对于撤入印度的中国远征军残部，一开始英军竟然打算对其缴械并将官兵们关入难民营，足见在英国人骨子里，就没真正拿中国军队当友军看待。
在中方的力争及美国的介入下，英国方面的企图并未得逞，而且后来在训练装备中国驻印军问题上，英国方面也提供了大批服装、食品和军饷，算是缓和了两国关系。1944年5月，英国又向中国提供812万英镑的贷款。虽然双方有共同利益诉求，有合作抗敌的共同意愿，但在作战及一些战后安排问题上，中英之间仍龃龉不断。
