斩首
因为杀人过多导致民怨沸腾，为了平息民怨，朱元璋甚至连主审官员吴庸都杀了。另外担心如此大的贪污数额引发不良反应，只对外公布郭恒等人贪污秋粮700万石。
而到了明朝中后期，皇帝疏于打理朝政，对于贪腐官员的处罚更是随意。嘉靖朝巡按御史黄廷聘因贪污数额巨大“金银诸物甚夥”，被衡山县令陈安志奏报弹劾，按《大明律》应当处斩，最后也只是受到“冠带闲住”的处分。
律法严苛，但没有依法治国的理念，判罚尺度全凭皇帝一人把握，最后连主审官员都成了刀下亡魂，这就导致律法不仅达不到惩治贪官污吏的目的，反而会严重挫伤官吏行政的积极性和主动性，更打击了学子入仕的积极性，影响高质量官员的选拔。
监察御史断案
缺乏对监察机关的有效监督和制约，监察机关执法犯法
法律制定了，就需要人来执行。为确保法律的严格执行，朱元璋在朝廷设立了最高反腐机构都察院，将刑、检、法职能集于一身。之后又设置六科给事中，专事纠举弹劾六部中的贪官污吏。
在地方，除有朝廷委派的监察御史外，又在各省设按察司，掌监察之职；后来他还设立“巡抚”制度，由朝廷派亲信重臣到各地出巡，监察地方官吏。
监察御史官阶低微，但权力很大，外出巡查号称“代天子巡狩”，大事奏裁，小事可立决；六科给事中可以对高级官员进行监察检举；所有的监察机构都直通“天听”，直接向朱元璋汇报。
对民间朱元璋也是广开言路，在午门外设立“登闻鼓”，号召百姓击鼓鸣冤，允许、鼓励百姓民告官，甚至鼓励民众将贪官污吏直接绑赴京城治罪，要是有官员敢截访就满门抄斩。
此外，朱元璋还设立锦衣卫等特务机关对文武百官包括监察官进行全方位的监督，耳目之广效率之高堪称一绝，甚至出现早上贪腐晚上就有锦衣卫、监察官上门抓人的情况，可谓是“朝贪而夕狱”。
