在这种情况下，巴图提做出这种过激反应也就在情理之中了。根据黑匣子复原的情况来看，起飞后机长艾哈迈德·哈巴希就将飞机交接给了备飞机组，从容离开了驾驶舱。也就是这时，贾迈勒·巴图提突然关闭自动驾驶系统，降低推力，然后驾驶飞机冲向大海。
波音767曾在全球范围内被广泛使用，图为达美航空的波音767
但是，整个事件中有一件事让人感到疑窦丛生，那就是埃及方面对于这件事和美国有着截然不同的结论。埃及方面认为，这件事并不是因为贾迈勒·巴图提的个人情绪过于激动导致的，而是因为机械故障。但是美国方面很快给予反驳，称如果是机械故障，飞机不可能突然从高空坠落，36秒的时间就坠毁，波音767虽然机龄比较老，但是也不会发生这种恶性事故，所以只能是人为的。但是埃及仍旧咬死了这件事不放，990号航班空难也就只能成为一个罗生门。
埃及空军一个时期内的飞行员都是美国培训出来的
时隔多年，许多不一样的分析也浮出水面，有人认为贾迈勒·巴图提是被买通的，他的目标是为了消灭飞机上33名飞行员和一名埃及高级军官。但是很多人也持反对意见，毕竟为了刺杀目标就拉着飞机上其他人陪葬太过于惊世骇俗。而这起事故造成的影响就是，时至今日为止，美国和埃及都取消了从洛杉矶飞纽约的这段路程，改为纽约起飞直飞开罗。
