然而，随着叙利亚内战加剧，叙利亚总统阿萨德自顾不暇，根本无力支持哈马斯，迈沙阿勒不得不离开叙利亚，流亡到卡塔尔。2013年，埃及总统穆尔西遭罢黜，由军方支持的政府取代，埃及也不再支持哈马斯。
此后，在以色列和埃及封锁下，哈马斯控制下的加沙财政非常困难，甚至无力支付4万名政府工作人员的薪水。在这种状况下，2017年5月，分别身处卡塔尔首都多哈和加沙地带的哈马斯领导层成员通过远程视频会议，推选“温和派”哈尼亚接替迈沙阿勒为新领导人。当年10月，哈马斯同法塔赫在埃及开罗签署协议，同意将加沙交给法塔赫领导的巴勒斯坦自治政府，从而结束了十年分裂局面。不过，由于各种势力错综复杂，巴以和平之路依然并不乐观……
